夜间实验台:全息蛋白丝带、移液枪头盒与多孔板
配图:计算设计落到湿实验台面的一刻, AI 生成配图,非新闻照片

药物早期最磨人的一步,常常不是“想出一个分子名字”,而是设计能牢牢咬住靶点的蛋白 binder,再送到湿实验台验证。Anthropic 8 月 18 日的研究帖给出一组可核对数字:Claude(Mythos Preview 与 Opus 4.8)对 15 个靶点设计 minibinder,外部评估显示 14 个靶点成功;单次设计命中率在 22%–35%,而今天蛋白设计战役的常见水平大约是 10%–15%。有些高亲和力设计甚至超过已发表最佳结果。

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官方流程很具体。多靶点模式:Opus 4.8 与 Mythos Preview 在 48 小时墙钟、最多约 12,500 个 H100 小时内同时打全部靶点,命中率约 22.6% 与 26.7%。单靶点模式:Mythos Preview 每靶 24 小时、最多约 2,500 H100 小时,命中率升到 35.1%。Claude 自行选结合位点、编排结构/序列设计与共折叠模型、多轮优化,再交给 Adaptyv Bio 与 Twist Bioscience 验证;人类主要批网络权限和盯基础设施。第二项:给 Opus 5 合同实验室的 NMR 与 LC-MS 原始文件加两句提示,分别用 23 与 19 分钟交出结果,氢计数与纯度(96.4% vs 96.33%)对齐实验室分析。

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值得拆开的不是“AI 会做药”的口号,而是分工变了:专家模型仍负责折叠与打分,Claude 负责战役编排——选位点、循环优化、多样性筛选。Adaptyv 竞赛靶点上,Mythos Preview 单靶对 RBX1 做到 40% 命中,参赛者约 3.7%;Opus 4.8 还在 TNFα 上做出跨物种 binder,而 Mythos Preview 失败——官方坦承不知道原因。作者判断:这更像把“计算生物学家几周的操作手册”压缩成一次可审计的 agent 会话,而不是替代湿实验本身。

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行业读法会分裂。药企会盯命中率与亲和力是否可复现、提示词与算力预算能否迁移;安全侧会盯 Mythos 级生命科学能力仍被门控、科学家准入计划尚未完全放开的事实。Anthropic 也写明:加速药物研发还有大量政策与运营瓶颈,不只是模型能力。外部湿实验由合作方完成,读者应把“14/15 靶点成功”理解为官方公布的合作评估结果,而不是公开可下载的完整原始板数据。

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如果把 FLT 式数学验证看作“秒级可复查”,蛋白设计则把验证成本抬回周级。Anthropic 选择先公开可比较的靶点与命中率,是在用实验科学的慢时钟证明 agent 编排有用。收束:下一阶段竞争不在再堆一个生成器,而在谁能把编排日志、湿实验回传与准入护栏做成同一条流水线。

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